Проф. Доктор Эркан Каптаноглу окончил медицинский факультет Джеррахпаша Стамбульского университета в 1990 году. Прошёл стажировку в Англии. После прохождения обязательной службы он стал ассистентом отделения хирургии мозга и нервов в учебно-исследовательской больнице Анкары Нумуне. В 1995 году защитил специальность в исследовательских лабораториях Университета Хаджеттепе по теме «Нейрозащита при травме спинного мозга». Завершил специализацию в 1997 году, стал специалистом и был назначен главным помощником. Он выиграл стипендию Министерства здравоохранения и работал в Университете Торонто в Канаде с 1998 по 1999 год. Он работал с Чарльзом Татором над «травмой спинного мозга и регенерацией спинного мозга» в течение года. Вернувшись в Канаду в 1999 году, министерство здравоохранения поручило ему открыть полевой госпиталь и в течение двух месяцев работать с Красным Полумесяцем в районе Хаккари-Шемдинли.
Он стал адъюнкт-профессором нейрохирургии в 2004 году. В период с 2000 по 2005 год он защитил докторскую диссертацию по передовым неврологическим наукам в Институте медицинских наук Университета Хаджеттепе и получил звание доктора наук (PhD) в 2005 году. Он участвовал в проекте терапии аутологичными стволовыми клетками при травмах спинного мозга человека в клиниках нейрохирургии и гематологии медицинского факультета Университета Анкары. В 2009 году он был назначен заместителем начальника 1-й нейрохирургической клиники больницы Анкара Нумуне, где он и работал.
В больнице Анкары Нумуне, где он проработал до 2010 года, он столкнулся со многими сложными случаями, ожидающими решения из-за плотности пациентов. Он руководил и сопровождал операции в сложных случаях, таких как черепная (головной), спинной (спинной мозг), детская (детская), травматологическая и сосудистая (сосудистая) нейрохирургия. Он продолжил свои академические исследования в лабораториях кафедры анатомии Университета Анкары, Университета Анкары и Университета Хаджеттепе с целью разработки сложных операций на позвоночнике. Доктор Во время научных, лабораторных и анатомических исследований Каптаноглу он сотрудничал со многими коллегами преподавателей из клинических и фундаментальных наук. Этот опыт внес большой вклад в хирургическую практику и клинику.
Он выполнил свой первый исследовательский проект по лечению травм спинного мозга в Университете Хаджеттепе, где он работал во время ассистента в 1995 году. После этого он продолжил свои экспериментальные исследования. Он получил множество наград, особенно за исследования анатомии травм спинного мозга и хирургии позвоночника. Его исследования были опубликованы в виде более 100 международных и национальных статей и более 50 книг и глав в книгах. Его приглашают в качестве инструктора на многие национальные и международные курсы и встречи.
В 2010 году он отправился на Кипр, чтобы основать больницу медицинского факультета Ближневосточного университета под руководством Университета Хаджеттепе, и был назначен профессором. В период с 2010 по 2015 год он занимал должность руководителя отделения нейрохирургии Ближневосточного университета и заместителя главного врача-основателя больницы Ближневосточного университета в ТРСК.
В 2015 году он был назначен на медицинский факультет Университета Мармара, отделение нейрохирургии, и был избран руководителем отделения. Он вступил в должность директора Института неврологических наук, на который был назначен в тот же день. По истечении пенсионного периода в 2019 году он ушел в отставку с должности директора Института неврологических наук и академического члена медицинского факультета. Во время своего пребывания в университете Мармара он руководил и сопровождал операции черепных пациентов, особенно глиом, менингиом и аденом гипофиза, опухолей головного мозга, кровоизлияния в мозг, болезни паркинсона, травм и сосудистой нейрохирургии. Он проводил исследования по операциям в сложных случаях хирургии позвоночника, таких как хирургия деформации позвоночника, такая как сколиоз и кифоз, торакоскопическая хирургия позвоночника и хирургия опухоли крестца. Помимо анатомических исследований, он также проводил экспериментальные исследования и лабораторные исследования по терапии стволовыми клетками и регенерации при травмах спинного мозга.
Он работал членом и менеджером в различных органах и группах Турецкой ассоциации нейрохирургии, в журналах Turkish Neurosurgery Journal и Turkish Neurosurgery. В период с 2019 по 2020 год он по совместительству преподавал в Башкентском университете. Он по-прежнему продолжает свою клиническую практику и операции в своей частной клинике, проводя национальные и международные академические исследования.